Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HMGB4Q8WW32 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HMGB4Q8WW32 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms