Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC12Q8WUD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC12Q8WUD4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC12Q8WUD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms