Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD06

AGR3, Anterior gradient protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGR3Q8TD06 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGR3Q8TD06 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGR3Q8TD06 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms