Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MDM1Q8TC05 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MDM1Q8TC05 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MDM1Q8TC05 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms