Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
KLHDC4Q8TBB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KLHDC4Q8TBB5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms