Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSDMBQ8TAX9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSDMBQ8TAX9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms