Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C9orf43Q8TAL5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C9orf43Q8TAL5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms