Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NEDD1Q8NHV4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NEDD1Q8NHV4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NEDD1Q8NHV4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms