Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CFAP61Q8NHU2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CFAP61Q8NHU2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CFAP61Q8NHU2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms