Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM58Q8NG06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRIM58Q8NG06 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms