Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC148Q8NFR7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms