Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD4

Uncharacterized protein FLJ76381, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NFD4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q8NFD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q8NFD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q8NFD4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q8NFD4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q8NFD4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q8NFD4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q8NFD4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q8NFD4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q8NFD4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q8NFD4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q8NFD4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q8NFD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q8NFD4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Q8NFD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms