Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMG8Q8ND04 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMG8Q8ND04 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG8Q8ND04 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms