Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCX0

CCDC150, Coiled-coil domain-containing protein 150, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC150Q8NCX0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC150Q8NCX0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC150Q8NCX0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC150Q8NCX0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms