Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MFSD2AQ8NA29 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MFSD2AQ8NA29 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MFSD2AQ8NA29 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms