Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNX31Q8N9S9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNX31Q8N9S9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms