Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC89Q8N998 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC89Q8N998 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms