Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
IGSF1Q8N6C5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
IGSF1Q8N6C5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IGSF1Q8N6C5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms