Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC33Q8N5R6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC33Q8N5R6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC33Q8N5R6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms