Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
STAG2Q8N3U4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
STAG2Q8N3U4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms