Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00269Q8N2A0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00269Q8N2A0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms