Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC00528Q8N1L1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC00528Q8N1L1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms