Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NLGN4XQ8N0W4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLGN4XQ8N0W4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms