Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB3

SRRM1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 904 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM1Q8IYB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRM1Q8IYB3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRRM1Q8IYB3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SRRM1Q8IYB3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms