Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RHOT2Q8IXI1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RHOT2Q8IXI1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms