Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APLFQ8IW19 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APLFQ8IW19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms