Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KSR1Q8IVT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KSR1Q8IVT5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KSR1Q8IVT5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms