Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV61

RASGRP3, Ras guanyl-releasing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP3Q8IV61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RASGRP3Q8IV61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RASGRP3Q8IV61 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RASGRP3Q8IV61 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms