Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PACS2Q86VP3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PACS2Q86VP3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS2Q86VP3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS2Q86VP3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PACS2Q86VP3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PACS2Q86VP3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms