Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ALYREFQ86V81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALYREFQ86V81 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms