Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HAPLN4Q86UW8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HAPLN4Q86UW8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms