Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RIMS1Q86UR5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RIMS1Q86UR5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
RIMS1Q86UR5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RIMS1Q86UR5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms