Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNA2D4Q7Z3S7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms