Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3J3

RGPD4, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4Q7Z3J3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
RGPD4Q7Z3J3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
RGPD4Q7Z3J3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RGPD4Q7Z3J3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms