Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT4

SSX8, Protein SSX8, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX8Q7RTT4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSX8Q7RTT4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSX8Q7RTT4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms