Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.385e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 DHRS7-206ENST00000555171 563 ntTSL 217.23■□□□□ 0.355e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 216.5■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 HPRT1-202ENST00000462974 724 ntTSL 316.45■□□□□ 0.227e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.215e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.125e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-208ENST00000463092 968 ntTSL 215.52■□□□□ 0.085e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-205ENST00000460906 820 ntTSL 514.33□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-218ENST00000491773 676 ntTSL 214.32□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-218ENST00000620879 4352 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.355e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-213ENST00000473012 632 ntTSL 312.82□□□□□ -0.365e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EXTL2-204ENST00000450240 902 ntTSL 412.59□□□□□ -0.395e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-203ENST00000434478 600 ntTSL 311.68□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-220ENST00000496439 800 ntTSL 211.66□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V1A-205ENST00000475322 754 ntTSL 311.62□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.565e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 211.37□□□□□ -0.595e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt10.9□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 HPRT1-201ENST00000298556 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.687e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-216ENST00000490385 860 ntTSL 510.75□□□□□ -0.695e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.765e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-208ENST00000482232 860 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V1A-206ENST00000496747 710 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-204ENST00000460334 663 ntTSL 59.64□□□□□ -0.875e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTCB-204ENST00000485373 564 ntTSL 49.52□□□□□ -0.895e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.945e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UROD-206ENST00000461035 486 ntTSL 1 (best)8.68□□□□□ -1.025e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V1A-204ENST00000470455 2266 ntTSL 28.68□□□□□ -1.025e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EXTL2-203ENST00000416479 730 ntTSL 28.6□□□□□ -1.035e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.115e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTCB-205ENST00000487704 767 ntTSL 28.02□□□□□ -1.135e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 FKBP4-205ENST00000543037 727 ntTSL 27.56□□□□□ -1.25e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-211ENST00000587299 1000 ntTSL 37.24□□□□□ -1.255e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.328e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTCB-203ENST00000476619 594 ntTSL 46.73□□□□□ -1.335e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SF3B1-207ENST00000468925 510 ntTSL 25.87□□□□□ -1.475e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 M6PR-210ENST00000543834 412 ntTSL 25.75□□□□□ -1.492e-12■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 GTF2I-205ENST00000464471 555 ntTSL 45.39□□□□□ -1.555e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 HPRT1-203ENST00000475720 599 ntTSL 35.13□□□□□ -1.597e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 CTSZ-204ENST00000503833 955 ntTSL 1 (best)22.84■■□□□ 1.253e-9■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 UGGT1-205ENST00000438277 3113 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.129e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TNFRSF10A-202ENST00000519862 342 ntTSL 311.13□□□□□ -0.639e-9■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SEZ6L2-206ENST00000563118 909 ntTSL 518.95■□□□□ 0.621e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.074e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 417.88■□□□□ 0.451e-41■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RCN3-205ENST00000598833 607 ntTSL 315.59■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTN4-215ENST00000491592 860 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-13■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 RTN4-213ENST00000485749 832 ntTSL 26.57□□□□□ -1.362e-13■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC1A5-206ENST00000598022 276 ntTSL 314.29□□□□□ -0.124e-18■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SERPINA5-204ENST00000554220 586 ntTSL 410.59□□□□□ -0.716e-7■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TMEM165-202ENST00000502797 639 ntTSL 35.98□□□□□ -1.452e-10■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.136e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.846e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.246e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.386e-8■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-206ENST00000446780 1400 ntTSL 215.86■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-204ENST00000434865 1163 ntTSL 215.61■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-205ENST00000440610 1008 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-207ENST00000449221 1061 ntTSL 215.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 LMAN2L-203ENST00000434524 2410 ntTSL 513.13□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SERPING1-207ENST00000457869 569 ntTSL 424.16■■□□□ 1.463e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SERPING1-206ENST00000405496 648 ntTSL 413.39□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 COLGALT2-202ENST00000367520 2325 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.63e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ELOVL2-201ENST00000354666 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.833e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.843e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 48.64□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 ABHD2-208ENST00000568308 502 ntTSL 37.61□□□□□ -1.195e-9■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 26.28□□□□□ -1.43e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC39A10-209ENST00000465851 2009 ntTSL 55.86□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.83e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.853e-6■■■■□ 23
SND1Q7KZF4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.712e-8■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.662e-8■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 NPTN-208ENST00000565282 1247 ntTSL 1 (best)17.38■□□□□ 0.373e-8■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 NPTN-207ENST00000564551 586 ntTSL 314.74□□□□□ -0.053e-8■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.859e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.799e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.759e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.729e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.719e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.219e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 TOR1B-202ENST00000427860 702 ntTSL 317.04■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 TOR1B-204ENST00000488169 516 ntTSL 313.65□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.363e-6■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.32e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-9■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 PLPPR3-202ENST00000517665 362 ntTSL 313.22□□□□□ -0.292e-7■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.761e-8■■■■□ 22.9
SND1Q7KZF4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.731e-8■■■■□ 22.9
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