Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2AFVQ71UI9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2AFVQ71UI9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1951.8 ms