Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PREX2Q70Z35 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PREX2Q70Z35 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PREX2Q70Z35 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms