Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYDE1Q6ZW31 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYDE1Q6ZW31 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms