Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNI0

GCNT7, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 7, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT7Q6ZNI0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GCNT7Q6ZNI0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GCNT7Q6ZNI0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms