Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NSMFQ6X4W1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NSMFQ6X4W1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NSMFQ6X4W1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms