Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI9

NPNT, Nephronectin, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPNTQ6UXI9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NPNTQ6UXI9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NPNTQ6UXI9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NPNTQ6UXI9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms