Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMBQ6PCB8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMBQ6PCB8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.9 ms