Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASC4Q6P4E1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASC4Q6P4E1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms