Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SLC27A4Q6P1M0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC27A4Q6P1M0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms