Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC102BQ68D86 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC102BQ68D86 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC102BQ68D86 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms