Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LARP1BQ659C4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LARP1BQ659C4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms