Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX4Q63HM2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX4Q63HM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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