Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
CHIC1Q5VXU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
CHIC1Q5VXU3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
CHIC1Q5VXU3 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms