Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FAM46CQ5VWP2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM46CQ5VWP2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM46CQ5VWP2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms